Lalu pada tahun 1925 beliau beserta keluarganya memutuskan untuk menetap di Pekalongan, tepatnya di Simbang Kulon.
BACA JUGA:Mengunjungi Makam Pejuang Islam di Pekalongan, Alim dan Bijaksana dalam Memimpin Umat
Di Pekalongan, Kyai Amir tetap mengajar dan berdakwah menyebarkan ilmu yang sudah didapat, beliau juga sempat mendirikan pondok pesantren di Pekalongan.
Banyak ulama besar yang pernah mengaji pada KH. Amir Idris, di antaranya adalah Kyai Mahrus Aly (Lirboyo), Kyai Ali Maksum (Krapyak), Kyai Muhammadun (Pati), dan masih banyak yang lainnya.
2. KH. Ahmad Subki Masyhadi
Makam kyai besar di Pekalongan yang selanjutnya adalah makam seorang ulama alim pendiri Pondok Pesantren Al-Masyhad Manba'ul Falah Wali Sampang, Kota Pekalongan.
Beliau KH. Ahmad Subki Masyhadi dimakamkan di kompleks pemakaman Sapuro, berdekatan dengan makam leluhurnya sekaligus ulama besar di Pekalongan juga, yakni Syekh Umar Khottob. Tidak jauh dari kubah makam Habib Ahmad bin Abdullah al-Athas.
BACA JUGA:Dikenal sebagai Pendakwah yang Humoris, Almaghfurlah KH Su'udi Kergon ternyata Ahli Tirakat
Kyai Subki Masyhadi lahir di Pekalongan pada tanggal 9 September 1933 M. Ayah beliau bernama KH. Masyhadi yang silsilah nasabnya sampai pada Sunan Gunung Djati Cirebon.
Sedangkan ibundanya bernama Ibu Hj. Mustiah, putri dari Syekh Umar Khottob. Silsilah dari jalur ibu sampai pada Ki Ageng Pekalongan yang dimakamkan di Wonobodro.
Pendidikan beliau didapat dari beberapa ulama besar, di antaranya adalah Mbah KH. Abdullah Zaeni (Demak), Mbah KH. Ma'shum (Lasem), KH. Noer Fathoni (Kendal), dan masih banyak lagi.
3. KH. Akrom Shofwan
Lahir di Pekalongan pada tanggal 12 Desember 1947 dari pasangan KH. Shofwan dan Hj. Timu, Kyai Akrom menjadi ulama yang memiliki pemahaman tentang kitab klasik yang luar biasa.
BACA JUGA:Manaqib Kakek Habib Luthfi bin Yahya, Maulana Habib Hasyim bin Umar bin Yahya Pekalongan
Sewaktu mondok di Lirboyo, beliau sangat masyhur sebagai santri yang ahli di bidang Bahtsul Masail, forum diskusi untuk menyelesaikan berbagai masalah dalam agama.